Quina diferència hi ha entre un motiu i un domini en una proteïna?


Resposta 1:

Gràcies per A2A,

però crec que Ameya Dravid ha respost correctament la vostra pregunta.

Així doncs, bàsicament, un motiu proteic és una estructura supersecondària formada per hèlix alfa i / o fulla beta i bobina aleatòria. Pot ser que no necessàriament tingui funcions biològiques.

No obstant això, els dominis proteics són 3 dimentionals estructurats en / en una proteïna que poden interactuar amb altres proteïnes / macromolècules / molècules i tenen algunes funcions biològiques. Per exemple, els factors de transcripció (TF) són un grup de proteïnes que tenen "dominis que uneixen l'ADN". Els TF se situen en el segment promotor o potenciador de l'ADN utilitzant el seu "domini d'unió a l'ADN) abans / durant la síntesi d'ARN a partir de l'ADN. Alguns TF tenen un domini que s’uneix a la ranura major de l’ADN, altres s’uneixen a la ranura menor.

Edita 1:

Els motius no són independents estables (no estables fora de la proteïna). Els motius poden formar part de dominis.

Els dominis són independents estables.

Edita 2:

Si un motiu pot tenir una funció biològica, es pot anomenar domini. Ex .: Els motius del dit del zinc estan relacionats amb la unió a l'ADN, per la qual cosa també es diuen dominis del dit del zinc.

Així doncs, tots aquests mitjans, els motius són característics estructurals i els dominis són regions funcionals d’una proteïna.


Resposta 2:

El motiu es defineix com l'estructura super secundària d'una proteïna. Poden ser tan petits com el tripeptidi, una simple seqüència amino que participen principalment en algun paper funcional per a la proteïna. Entre els exemples hi ha el motiu de la clau grega, el motiu del dit de cinc, el llaç Omega, etc. Els motius són part del domini principalment, però viceversa no és possible.

Els dominis són entitats estructuralment grans i impliquen l’estructura quaternària de la proteïna. Es tracta de parts de proteïna plegades de forma independent, que es poden diferenciar tant estructuralment com funcionalment. Generalment es consideren que són les unitats que es repeteixen en proteïnes grans. Els exemples inclouen el barril beta, el domini PDZ, el plec de globina que es troba principalment en immunoglobulines, les repeticions de cadherina que es troben a les proteïnes d'adhesió depenent del calci.


Resposta 3:

Un motiu proteic és una estructura supersecondària que conté múltiples estructures secundàries en una disposició estable, i es troba habitualment en altres proteïnes, no necessàriament tenint cap semblança en la seva funció.

per exemple: el llaç Omega és un motiu proteic amb qualsevol seqüència d’aminoàcids, amb l’única condició que ha de poder formar una estructura estable que s’assembli a la lletra grega omega. Això fa que el motiu sigui extremadament comú, però no es pot dir res sobre la seva importància en la funció de la proteïna.

Per contra d’això, un domini proteic és una estructura estable amb una funció específica i definida en la proteïna i pot existir independentment de la proteïna, és a dir, pot mantenir la seva estructura encara que estigui separat de la proteïna.

per exemple: els dominis SH2 (src homology 2) es troben a les vies de senyalització de la ruta JAK-STAT que s'encarreguen de controlar la transcripció de certs gens. La funció d’aquest domini és unir la proteïna que conté aquest domini a llocs específics de la proteïna de membrana.